DIADE
contact : Francois Sabot
Description :expertise en IA en bioinformatique pour l’analyse structurale et fonctionnelle du génome des plantes
Exemples d’utilisation d’IA appliquée aux thématiques de l’unité :
Realisation de graphes de pangenomes à partir de sequencage bas débit de type genome skimming
Amelioration de la détection / classification des séquences répétées dans les génomes
Utiisation dans le traitement des données massives du domaine agronomique et biodiversité
Extraction d’entités biologiques et de relations dans les publications scientifiques (NLP)
Représentation des connaissances et ontologies dans le domaine agronomique et biodiversité
Base de connaissances, Web Sémantique et données FAIR en biologie
Raisonnement sur les données biologiques
Machine/Deep learning pour la priorisation de genes candidats